Le SG assiste les ministres de l’éducation nationale et de l’enseignement supérieur pour l'administration de leur ministère. Il dirige le secrétariat général, composé d’une direction générale, de cinq directions, de deux délégations et de trois services. Il est assisté, pour l'ensemble de ses fonctions, par deux secrétaires généraux adjoints et par une équipe d’appui d’une trentaine de personnes.

Chargé de veiller à la cohérence de l'action ministérielle, il assure la coordination administrative entre les directions générales et l'animation territoriale dans les domaines relevant de sa compétence.

Il conduit les réflexions stratégiques relatives à l'organisation et à l'administration des ministères. Elle définit et met en œuvre les politiques de modernisation administrative. Il s'assure de la prise en compte des objectifs de performance des programmes budgétaires. Il coordonne les dispositifs de contrôle interne pour la maîtrise des risques mis en place au sein de ces ministères. Il assure la coordination des travaux du CSE et des CTM. Le SG est responsable du programme "soutien de la politique de l'éducation nationale" (2,6 Mds LFI 2022).

Le SG exerce les fonctions de haut fonctionnaire de défense et de sécurité et dispose à ce titre du service de défense et de sécurité. Il coordonne la politique de sécurité de l'espace scolaire et universitaire en lien avec la DGESCO et la DGESIP.

Compte tenu du rôle central du SG, l’exercice de ces foncions nécessite une capacité à disposer d’une vision stratégique à 360° de l’ensemble des politiques décidées par les ministres. L’emploi de SG requiert des compétences de très haut niveau en matière de coordination, de pilotage et de dialogue social. En tant que HFDS, le SG doit faire preuve d’une capacité exemplaire dans le pilotage et la gestion de crise.